El río de los Patos, que nace en las estribaciones del Aconcagua (6.959 m) y desciende en sentido suroeste-noreste a través del valle de los Patos y del valle de Calingasta recibiendo a un gran número de afluentes por ambas márgenes.
El río los Patos es, junto con el río Castaño, el principal componente del río San Juan que surge de la confluencia de ambos en los alrededores de Villa Corral.